新校区图书馆目前正在建设中，现开放的临时图书馆坐落于学校西区，总建筑面积4523.4平方米。图书馆坚持纸本文献和电子文献并重、实体馆藏与虚拟馆藏并重，形成了以中医药学为主、多学科协调发展的藏书体系。

正在建设中的新校区图书馆，主体建筑5层，建筑面积27000余平米。秉承科学服务理念，以最大限度方便读者利用为目标，推行大开放、大服务格局，采用藏、查、借、阅、参一体的服务模式。设有综合阅览区、电子阅览区、期刊阅览区和工具书阅览区，座席总数约2000个。设有密集书库，为加强纸质文献资源建设提供保障。设有多功能报告厅、研讨室、多媒体体验区、休闲讨论区和放映厅，满足读者的不同需要。引进座位管理系统、3D导航、自助借还等智能化信息管理系统，使图书馆的现代化服务水平日益提高。